Dawson decide di girare un film per la scuola sul processo delle streghe di Salem e per fare questo si reca assieme a Pacey, Jen e Joey alla Witch Island. Qui Jen e Pacey decidono che potrebbero fare sesso, dal momento che entrambi pensano che l'amore rovini sempre tutto, ma non ci riescono; Joey e Dawson invece analizzano la loro relazione attuale. Andie nel frattempo viene assunta come capo del comitato scolastico e fa di tutto per risultare efficiente; lo è talmente tanto che punisce tutti gli studenti per aver violato varie regole del vecchio codice di comportamento, facendosi riprendere dal preside. I quattro amici sono riluttanti a credere alle streghe, ma quando si ritrovano di notte in mezzo al bosco in una chiesa abbandonata che prende improvvisamente fuoco, spaventati, si ricredono; il fuoco sparisce improvvisamente così com'è venuto e i ragazzi decidono di tornare sulla terraferma. Riguardando le registrazioni poi intravedono sul molo le sagome di due persone e il dubbio di chi siano resterà irrisolto.