Quinze anos após um trágico acidente numa central nuclear japonesa, a humanidade descobre uma verdade escondida: que há monstros colossais, mais antigos que a Humanidade, e que já foram os senhores da Terra. Enquanto a maioria está adormecida, a vida humana encontra-se indefesa perante o ataque de algumas criaturas que despertaram. Cabe ao monstro mais famoso do mundo restaurar o equilíbrio, mas primeiro os humanos precisam de aprender a confiar nele.