Dexter Morgan våkner opp fra koma og oppdager at Harrison er forsvunnet sporløst. Dexter innser hvor mye han har utsatt sønnen for, og drar til New York City, fast bestemt på å finne ham og gjøre opp for seg. Men det blir ikke lett å få avslutning. Når Angel Batista fra Miami Metro kommer med spørsmål, innser Dexter at fortiden hans raskt innhenter ham. Mens far og sønn navigerer gjennom sin egen mørke side i byen som aldri sover, finner de seg snart dypere enn de noensinne hadde forestilt seg – og at den eneste veien ut er sammen.