Stilletjes aan is er een invasie gaande op de aarde. Parasiterende wormen kruipen via de neus of oren naar de hersenen van mensen en nemen zo controle over hen. De doodnormale scholier Shinichi Izumi ontsnapt door puur geluk aan dit lot en de parasiet “Migi” gaat in zijn handpalm zitten. De twee komen tot een symbiotische overeenstemming waarbij hun beider persoonlijkheden intact blijven. Ze besluiten samen andere parasieten te gaan bevechten, die de mensen louter als voedsel zien.