南北戦争時代のアメリカ。南軍の捕虜となっていたハーディング大尉ら北軍の5人の兵士は、気球に乗って敵地から脱走する。だが、気球は天空に開いた奇妙な穴に飲み込まれ、気が付くと見知らぬ孤島に漂着していた。危険な怪物がうろつく島を探索する中で、彼らは墜落した“空飛ぶ機械”に乗っていた若い2人の姉妹ジュールズとアビーを救出する。大尉が話を聞くと、彼女たちはなんと2012年の未来からこの島に迷い込んだという。