ある日、幸せだったキャラウェイ家を突然の不幸が襲った。妻であり母であったアリソンが手首を切って自殺したのだ。その光景を見た９歳の一人娘エミリーは、それ以来、堅く心を閉ざしてしまう。そんな娘の心を癒やすため、心理学者である父デビッドは、ニューヨーク郊外の湖のほとりにある静かな町へと移り住むことに。しかし、心を閉ざしたままのエミリーは、いつしかチャーリーという“見えない友達”と遊ぶようになる。