Si pensa che un agente sia morto in un incidente d'auto, fino a che le prove sulla scena del crimine non provano il contrario. L'agente non era morto durante l'incidente, e non era stato ucciso perché non era l'autista della macchina danneggiata. Si trova un altro corpo e Ducky conduce l'autopsia e scopre che è stata uccisa, ma poco prima di morire aveva dato alla luce un bambino, conducendo la squadra a pensare che il killer abbia preso il bambino. Si scopre, invece, che non è così facile come sembra. Alla fine, la squadra è a casa della famiglia nuovamente riunita. Tony va vicino al caminetto e si siede, da solo, guardando la coppia felice con il loro bambino, e Gibbs, McGee e Ziva rilassati e sorridenti. Tony tira fuori una busta dalla giacca, la apre e legge "Tony, non tornerò indietro. Devi scegliere. Jeanne". Ha un flashback dove vede lui e Jeanne insieme, felici, in un letto. Tony guarda verso Ducky e la coppia con il bambino e poi di nuovo verso Gibbs, McGee e Ziva. Butta la lettera nel fuoco e cammina verso il team. Ziva e McGee guardano verso Tony, mentre Gibbs guarda verso la lettera che brucia.