Thor käy taisteluun palauttaakseen kosmoksen järjestyksen ja pelastaakseen Maan ja kaikki Yhdeksän maailmaa mystiseltä viholliselta, joka on vanhempi kuin maailmankaikkeus itse. Mutta ikivanha kamppailu, jota johtaa kostonhimoinen Malekith, on vaarassa suistaa universumin takaisin pimeyteen. Uhkanaan vihollinen, jolle edes Odin ja koko Asgard eivät mahda mitään, Thorin on lähdettävä vaarallisimmalle ja henkilökohtaisimmalle matkalleen päästäkseen jälleen Jane Fosterin luo - ja lopulta hän joutuu uhraamaan kaikkensa pelastaakseen meidät muut.