Η ταινία αφηγείται τη δραματική ιστορία της μεγαλύτερης φυσικής καταστροφής που έχει χτυπήσει τον αρχαίο κόσμο, μια καταστροφή που προκάλεσε την πτώση ενός πολιτισμού και δημιούργησε ένα θρύλο. Γύρω στο 1620 π.Χ., ένα γιγαντιαίο ηφαίστειο του Αιγαίου ξύπνησε από τον ύπνο του που διήρκεσε περίπου 19.000 χρόνια. Η έκρηξη κατέστρεψε το νησί της Θήρας, παράγοντας τεράστια παλιρροϊκά κύματα που πλημμύρισαν το κοντινό νησί της Κρήτης, το κέντρο του πρώτου μεγάλου πολιτισμού της Ευρώπης - τον Μινωικό. Αυτό το συμβάν, όπως πολλοί ειδικοί πιστεύουν τώρα, ενέπνευσε τον αρχαίο Έλληνα φιλόσοφο Πλάτωνα και έγραψε για την Ατλαντίδα...