Po zničení Prokleté říše a konečné smrti všech jejích vězňů se nindžové náhle proslavili svou rolí a činy. Uprostřed jejich nově nabyté popularity se však objeví nová hrozba, když se v Ninjagu začne potulovat Clouse, který zkázu Prokleté říše přežil, aby způsobil další spoušť. Nindžové se ho pokusí zastavit, ale nakonec jsou potlačeni a nedokážou to. Clouse se vydá do Stiixu, kde najde starobylou Tyranovu konvici, v níž se nachází podvodný džin jménem Nadakhan, který Clouse po svém propuštění uvězní v konvici. Když nindžové dorazí do Stiixu, zjistí, že na ně někdo hodil sérii zločinů, a jsou pronásledováni obyvateli města. Nadakhan mezitím zjistí, co se stalo s jeho posádkou nebeských pirátů, a nakonec zajme Senseie Wu poté, co ho náhodou přivolal.